Стефан Марковски е роден на 1 декември 1990 г. в гр. Гевгелия, Северна Македония.
Завършил е обща и компаративна книжовност във Филоложкия факултет – Катедра “Блаже Конески”, а след това и специалност философия във Философския факултет на Университета “Св. св. Кирил и Методий” – гр. Скопие. Специализирал е и във Факултета за Драматични изкуства – филмови и телевизионни сценарии.
Автор е на книгите: “Еднопосочно” (роман, 2009), “Апейрон” (поезия, 2010), “За някои спомени на онази някогашност” (поезия, 2010), “Йерархична еволюция на съзнанието” (психология и философия, 2012), “Мета(де)конструкция и обща философия” (философия, 2012), “Щастието е глагол” (психология и философия, 2013), “Продавачът на вятър и мъгла и на други приказки” (разкази и драма, 2015), “In Nomine” (поезия, 2016), “Смъртта долита с насмешка” (разкази, 2017), “По следата на белия грифон” (поезия, 2018), “Ересни писма или Намирайки ги небесата, които сияят в червено” (роман, 2018).
Автор е на множество есета, статии и трудове в областта на теоретичното езикознание и философията. Автор е и на сценарии за късометражни и дългометражни филми. Част от творчество на Марковски е преведено на няколко езика.
Стефан Марковски е носител на множество литературни награди, между които: “Петре М. Андреевски” (2009) – за роман; втора награда на Македонската академия на науките и изкуствата – за разказ (2008); “Бели мъгли” – за поетическа книга (2016); “Кръсте Чачански” – за сборник от разкази (2017), “Книжовно перо” – награда на Хърватското книжовно дружество за преводна книга на годината (2017); Македонски книжовен авангард” – за сборник от разкази (2015); Седмоноемврийска награда на Община Гевгелия (2014) и още редица други.
Главен и отговорен редактор е на най-старото македонско литературно списание “Современост” – наследник на първото македонско списание за литература и култура “Нов ден”.
Член е на Дружеството на писателите в Република Македония, на Македонският център на ITI и на други творчески асоциации.